Charly Mottet a entamé une carrière de dirigeant dans le monde du cyclisme. Il a pendant plusieurs années été directeur adjoint du critérium du Dauphiné libéré et s'occupait alors du tracé du parcours. Un rôle qui lui a permis de devenir membre de l'UCI (Union des cyclistes internationales) World Tour. Entre 1995 et 2001 il a été membre de la direction de course sur Te tour de France. Il a été également sélectionneur de l'équipe de France de cyclisme en 1997 et 1998. Après avoir quitté son poste de directeur adjoint, il a rejoint, en 2010, l'organisation du Grand prix cycliste de Québec et de Montréal en tant que manager sportif. Il est également présent chaque année sur le Tour de France, où il pilote et accompagne les invités de la marque Orange.
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